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北京大学第一医院（简称“北大医院”）位于北京老皇城内，是距离中南海最近的医院，是一所融医疗、教学、科研、预防为一体的大型综合性三级甲等医院，是中央保健基地医院。北大医院创建于1915年，是我国最早创办的国立医院，也是国内首批建立的临床医学院之一。近百年来，我院拥有着一批国内的首创专业学科以及在我国率先开展的诊疗技术，如国内首创小儿科(1940）、泌尿外科(1946)、肾脏病专业(1950)、综合医院心血管病房(50年代)、小儿神经专业(50年代)等。

北京大学人民医院西直门院区位于北京市西直门南大街11号，白塔寺院区位于西城区阜成门内大街133号，始建于1918年，是一所集医疗、教学、科研为一体的三级甲等综合医院，是北京市医保定点医院，国家卫生计生委委管医院，北京大学附属医院，北京大学第二临床医学院，先后获得“全国卫生系统思想政治工作先进单位”、“全国医院（卫生）文化建设优秀成果奖”、“全国医院（卫生）文化建设先进集体”、“全国医药卫生系统创先争优活动先进集体”、“首都文明单位标兵”、“首都医药卫生文化建设先进单位”、“北京大学党务和思想政治工作先进集体”、“北京大学统战工作先进党委”等荣誉。

北京大学第三医院（简称“北医三院”）始建于1958年，是卫生部部管的集医疗、教学、科研和预防保健为一体的现代化综合性三级甲等医院。 现有在职职工2556人，开放床位1498张。医院设有34个临床科室、11个医技科室。拥有28个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师55人，中科院院士1人、国家自然科学基金杰出青年基金获得者1人、科技部“973”首席科学家1人、教育部 “长江学者特聘教授”2人，1人入选国家级“新世纪百千万人才工程”，卫生部突出贡献专家6人。

北京大学第六医院(北京大学精神卫生研究所、北京大学精神卫生学院)是北京大学精神病学与精神卫生学的临床医疗、人才培训与科学研究基地，是世界卫生组织(WHO)北京精神卫生研究和培训协作中心，也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。

北京大学肿瘤医院(北京肿瘤医院、北京大学临床肿瘤学院、北京市肿瘤防治研究所)始建于1976年，是一所由北京大学、北京市医管局共管的三级甲等肿瘤专科医院。

北京大学肿瘤医院设有34个临床科室，14个医技科室，17个基础研究科室,开放床位776张。全年门诊量66万人次，年收治病人7.8万人次，手术近1.6万例。医院职工近2400人，在编职工中正高级职称124人，副高级职称211人。

北京大学肿瘤医院有国家重点学科1个(肿瘤学)、国家临床重点专科2个(肿瘤科、病理科)、北京市重点学科4个(北京市胃癌防治中心、北京市乳腺癌防治中心、北京市影像介入治疗中心、超声诊断中心)、北京市中医管理局重点学科1个(中西医结合科暨老年肿瘤科)，全国名老中医药专家传承工作室1个，北京学者工作室1个，是恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室。

北京大学口腔医学院是国家重点口腔医学院校，实行口腔医学院、口腔医院、口腔医学研究所三位一体的管理体制。 其宗旨是培养高等口腔医学人才，普及和提高口腔疾病的预防和治疗水平，承担国家级及教育部、卫生部有关科研项目。